Аптека в зеленоградской больнице была открыта в 1966 г. и размещалась поначалу в здании перинатального центра. В 1972 г. ввели в эксплуатацию терапевтический корпус, и аптека переместилась на первый этаж здания, где находится до сих пор. В просторных, светлых помещениях работать стало удобнее, улучшилось техническое оснащение, появилось необходимое для работы оборудование.
Аптека обеспечивала медикаментами и изделиями медицинского назначения все отделения больницы. Главным отделом являлся стерильный блок, в котором изготавливались растворы для внутривенного введения.
Большая роль в работе аптеки отводилась производственному отделу, который занимался изготовлением растворов для внутреннего и наружного применения, порошков, микстур, мазей, свечей, настоев, отваров, глазных капель и экстемпоральных форм для детей в возрасте до 1 года.
В связи с открытием заводов по производству растворов для инъекций и серийным выпуском глазных лекарственных форм, детских микстур и прочих препаратов была сокращена внутриаптечная заготовка. Тем самым удалось добиться снижения риска развития нежелательных реакций (анафилактический шок и проч.)
Готовые лекарственные формы заводского производства полностью удовлетворяют потребности больницы. Аптека следит за правильностью назначения препаратов, условиями их хранения и ведением приходно-расходных документов в отделениях. Через аптеку подразделения больницы получают весь расходный материал, необходимый для работы.
Одним из важнейших составляющих успешной терапии является качественное и современное лекарственное обеспечение, которому в Городской клинической больнице уделяется особое внимание. В 2015 году (по сравнению с 2014 г.) был значительно расширен перечень лекарственных препаратов формулярного списка. С учетом результатов фармако-экономического анализа введено в перечень более 30 дорогостоящих препаратов, увеличены расходы на приобретение лекарственных средств на 41%.

Заведующая аптекой. Специализация – «фармация». Имеет сертификат «Управление и экономика фармации». Провизор высшей категории. Общий стаж– 20 лет, работает в ГКБ им. М. П. Кончаловского (ранее ГКБ №3) – 10 лет. На занимаемой должности – 8 лет.

Заместитель заведующей аптекой. Специализация «фармация». Имеет сертификат «Управление и экономика фармации». Провизор высшей категории, общий стаж работы – 29 лет, работает в ГКБ им. М. П. Кончаловского (ранее ГКБ №3) – 9 лет. На занимаемой должности – 5 лет.
Сотрудники аптеки провизоры и фармацевты являются специалистами высшей категории и имеют стаж работы свыше 20 лет.